12点，市气象台连续发布雷电黄色预警和暴雨蓝色预警。 2009年6月16日的降雨是从延庆开始的，上午8点到9点，延庆的降水量为3毫米。随着雨带的推进，密云也出现降雨，并逐渐向城区扩散。10时左右，海淀、平谷等地上空雷声隆隆，阴云密布，雨点纷纷落下。
随着降雨的扩大，强对流天气也在迅速发展，京城开始出现雷电交加的情况。上午11点，市区漆黑如夜，主要干道的汽车均打开了夜灯，写字楼和居民楼的灯光也相继亮起。不少市民纷纷躲进屋里，等待暴雨袭来。“黑昼”降临！气象专家表示，这是近几年来罕见的现象，而发生在初夏时节更是少之又少。据悉，“黑昼”在盛夏强对流天气之前时有出现，主要受高空对流云团的影响，饱含丰富水汽，压在低空，从而遮天蔽日，不让一点阳光穿透，因此形成“黑昼”，此次“黑昼”持续约半小时，直至暴雨袭来才“擦亮”了黑幕的颜色。